營養攝取的缺點
牛奶巧克力雖然是利用營養的牛奶以及巧克力所調製而成，不過由於牛奶裡面所富含豐富的鈣質，遇上巧克力本身的草酸，會形成草酸鈣，這種草酸鈣是人體所不能吸收的物質，所以會被排出體外，等於是讓身體無法吸收牛奶本身的鈣質，所以如果為了營養吸收，與其飲用牛奶巧克力，還不如直接喝新鮮的牛奶。食用禁忌
牛奶巧克力屬於高熱量食物，吃多容易發胖，在減肥中的人們不應食用過多。另外，巧克力中含有的咖啡因不適合攝取過多，若同一天內已經喝下數杯咖啡（如黑咖啡、義式濃縮咖啡、美式咖啡），就不應該再喝太多牛奶巧克力，以免增加身體對咖啡因的負擔。不過研究指出，巧克力本身的咖啡因含量很低，正常食用並不至於造成影響。